Для автоматизации уникальной линии оптимальным будет гибридный подход. Используйте проверенные промышленные контроллеры (ПЛК) как базис, а для специфических функций закажите разработку электроники под заказ. Это обеспечит надежность и индивидуальную подгонку. Полный цикл от проектирования до прототипа предлагают профильные компании, например, посмотрите услуги на сайте
https://ask-lab.com/ . Важно сформулировать детальное техническое задание с привязкой к технологическому процессу.